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綿羊IGFBP-3基因的克隆及序列分析
關(guān)鍵詞：克隆 基因 綿羊
摘要：旨在克隆IGFBP-3基因的CDS序列及其生物信息學(xué)分析，試驗(yàn)以涼山半細(xì)毛羊?yàn)檠芯繉ο?，采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-3基因的CDS全序列，生物信息學(xué)方法深入分析其序列。結(jié)果表明：IGFBP-3基因的CDS序列為882bp，編碼293個氨基酸，與牛、人、鼠的CDS同源性分別為94％、83％、81％，氨基酸序列同源性分別為91％、77％、79％，GenBank登錄號為FJ752574；IGFBP-3基因的氨基酸分子量為31．5KD，理論等電點(diǎn)（pI）為8．98；進(jìn)化分析顯示與牛、山羊等哺乳動物關(guān)系較近，與雞、魚類等親緣關(guān)系較遠(yuǎn)；IGFBP-3基因存在明顯的疏水性區(qū)域和親水性區(qū)域，有一個信號肽、25個磷酸化位點(diǎn)、7個N-糖基化位點(diǎn)和4個O-糖基化位點(diǎn)；二級結(jié)構(gòu)分析顯示無規(guī)卷曲、α-螺旋和β-折疊區(qū)域分別為73．04％、13．99％、12．97％；三級結(jié)構(gòu)分析顯示存在IGFBP—N和甲狀腺球蛋白-Ⅰ型功能域。為進(jìn)一步研究綿羊IGFBP一3基因的功能奠定基礎(chǔ)。
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