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產吡咯喹啉醌的生絲微菌內參基因的篩選和驗證

劉孟粟; 鐘璐芳; 柯崇榕; 高敏; 夏華平; 任洋; 黃建忠 福建師范大學工業(yè)微生物教育部工程研究中心; 福建福州350108

關鍵詞:吡咯喹啉醌 生絲微菌 內參基因 實時熒光定量pcr 

摘要:篩選生絲微菌表達調控研究中最適合的內參基因,為后續(xù)大幅度提高吡咯喹啉醌(PQQ)產量打下基礎。利用實時熒光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-qPCR)技術分析生絲微菌基因組中6個候選內參基因的相對表達情況,通過Best-keeper、geNorm和NormFinder軟件分析,評價各個生長時期候選內參基因的表達穩(wěn)定性,確定最合適的內參基因。結果表明:通過對生絲微菌4個不同生長時期的6個候選內參基因(16S rRNA、gapdh、recA、ldh、rpoB和S5)的轉錄情況進行分析和評估,6個候選內參基因均表現(xiàn)出較強的穩(wěn)定性和特異性,依據(jù)3款軟件的綜合評價,確定gapdh、recA這兩個內參基因在兩株菌株不同時期均能穩(wěn)定表達。從6個候選內參基因中篩選出兩個表達穩(wěn)定的內參基因gapdh基因和recA基因,用于后續(xù)生絲微菌的基因表達調控研究。

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