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轉(zhuǎn)錄組測序研究蘭州百合抗凍關(guān)鍵基因及途徑
關(guān)鍵詞：蘭州百合 低溫脅迫 轉(zhuǎn)錄組測序 差異基因 抗凍基因
摘要：【目的】百合(Lilium)是國家衛(wèi)生部首批公布的藥食同源植物,也是著名的觀賞植物。低溫凍害嚴(yán)重影響植物的產(chǎn)量和分布,探究蘭州百合對零下低溫脅迫應(yīng)答的分子機(jī)制。【方法】采用高通量IlluminaHiseq測序平臺對蘭州百合的20℃常溫對照與-4℃寒冷處理(D)進(jìn)行測序,并對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析研究?！窘Y(jié)果】處理24h后檢測到24465個差異表達(dá)的基因,篩選后獲得4143個表達(dá)量上升的基因和4415個表達(dá)量下降的基因,占差異表達(dá)基因總數(shù)的10.27%?！窘Y(jié)論】經(jīng)富集分析認(rèn)為,與蛋白激酶、蛋白磷酸酶、碳代謝以及ABA等相關(guān)的基因可作為研究蘭州百合零下低溫響應(yīng)機(jī)制的主要研究對象。qRT-PCR分析表明,隨機(jī)選出的10個差異性表達(dá)基因的表達(dá)趨勢與高通量測序結(jié)果相一致。此外,吲哚-3-甘油磷酸合成酶、蛋白磷酸酶、已糖激酶、鈣結(jié)合蛋白、葉綠素a/b結(jié)合蛋白等基因可作為與蘭州百合寒冷響應(yīng)相關(guān)的應(yīng)答候選基因,為揭示蘭州百合抗凍分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
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