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基于輻射防護(hù)基因集的抗輻射損傷先導(dǎo)化合物預(yù)測(cè)

劉禎; 楊曉曦; 王乃震; 伯曉晨 軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院輻射醫(yī)學(xué)研究所; 北京100850; 解放軍960醫(yī)院; 濟(jì)南250031

關(guān)鍵詞:先導(dǎo)化合物 輻射防護(hù)劑 基因表達(dá)譜 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù) lincs計(jì)劃 

摘要:目的利用基于網(wǎng)絡(luò)的細(xì)胞反應(yīng)印記整合文庫(kù)(LINCS)計(jì)劃的小分子化合物刺激不同細(xì)胞系的轉(zhuǎn)錄譜數(shù)據(jù),構(gòu)建算法評(píng)估化合物的抗輻射損傷活性,發(fā)現(xiàn)抗輻射損傷先導(dǎo)化合物。方法基于基因本體(gene ontology,GO)數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建輻射防護(hù)基因集,并基于基因集富集分析算法構(gòu)建算法評(píng)估化合物的抗輻射損傷潛能,預(yù)測(cè)具有抗輻射損傷活性的先導(dǎo)化合物。結(jié)果建立了4個(gè)具有抗輻射損傷效果的輻射防護(hù)基因集,以及利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)抗輻射損傷先導(dǎo)化合物的方法;在32 560個(gè)小分子化合物中預(yù)測(cè)獲得了299個(gè)抗輻射損傷先導(dǎo)化合物,其中17個(gè)已被報(bào)道具有抗輻射損傷活性。結(jié)論預(yù)測(cè)結(jié)果具有較好參考價(jià)值;預(yù)測(cè)方法速度快,成本低,可有效發(fā)現(xiàn)具有抗輻射損傷活性的化合物。

軍事醫(yī)學(xué)雜志要求:

{1}正文前要有300字左右的中文摘要,3~6條中文關(guān)鍵詞,中圖分類號(hào),與中文對(duì)應(yīng)的英文題目、摘要和關(guān)鍵詞,參考文獻(xiàn)完整。

{2}數(shù)字:執(zhí)行GB/T15835-1995《關(guān)于出版物上數(shù)字用法的規(guī)定》。公歷世紀(jì)、年代、月、日、時(shí)刻和計(jì)數(shù)、計(jì)量均用阿拉伯?dāng)?shù)字。

{3}題名須簡(jiǎn)明確切地反映本文的特定內(nèi)容,不要副標(biāo)題,一般不超過(guò)20 字。避免使用非公知公認(rèn)的縮略詞、字符、代號(hào)等。

{4}來(lái)稿稿件應(yīng)包括題目、摘要、關(guān)鍵詞、正文和參考文獻(xiàn)等內(nèi)容。來(lái)稿文責(zé)自負(fù),本刊有稿件刪改權(quán),如不同意,請(qǐng)來(lái)稿時(shí)注明。

{5}對(duì)文章主要作者的姓名、出生年、性別、民族(漢族可省略)、籍貫、職稱、學(xué)位等作出介紹,其前以“[作者簡(jiǎn)介]”作為標(biāo)識(shí),排在篇首頁(yè)地腳,基金項(xiàng)目之下。

{6}正文章節(jié)標(biāo)題占一行,用黑體,小標(biāo)題獨(dú)占一行,前空兩格,且一律用阿拉伯?dāng)?shù)字 (從1開(kāi)始) 表示,形式為1.1 1.1.1 1.2……2.2.1 2.2……

{7}注釋序號(hào)以“①、②”等數(shù)字形式標(biāo)示在被注釋詞條的右上角。頁(yè)末或篇末注釋條目的序號(hào)應(yīng)按照“①、②”等數(shù)字形式與被注釋詞條保持一致。

{8}參考文獻(xiàn)的著錄格式采用順序編碼制,著錄表置于文末,其排列順序以正文出現(xiàn)的先后為準(zhǔn),文內(nèi)用方括號(hào)按先后順序標(biāo)注,且置于行文的右上角。

{9}稿件應(yīng)文字精練,層次清晰,觀點(diǎn)明確,論據(jù)充分,數(shù)據(jù)可靠,說(shuō)服力強(qiáng)。

{10}文稿凡屬基金資助項(xiàng)目,應(yīng)寫(xiě)明基金項(xiàng)目名稱及項(xiàng)目編號(hào),基金項(xiàng)目名稱應(yīng)按國(guó)家有關(guān)部門批準(zhǔn)的正式名稱填寫(xiě),投稿時(shí)附基金項(xiàng)目證明復(fù)印件,本刊將優(yōu)先錄用和發(fā)表。

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