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基于遺傳算法酵母核小體定位性質(zhì)預(yù)測(cè)

郭亞茹; 豐繼華; 于華崢; 牟錦; 黃月月; 劉珂 云南民族大學(xué)電氣信息工程學(xué)院; 昆明650504

關(guān)鍵詞:核小體定位 酵母 分布模型 遺傳算法 

摘要:在DNA序列上,定位模糊的特殊核小體與定位良好的普通核小體同時(shí)存在于染色體區(qū)域內(nèi),但由于二者的化學(xué)性質(zhì)差異不明顯,區(qū)分較為困難。本文針對(duì)實(shí)驗(yàn)核小體在真核基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周圍的分布規(guī)律和保守性建立了一個(gè)核小體分布模型,并在前人所做的預(yù)測(cè)核小體位置的工作基礎(chǔ)上,利用遺傳算法尋找模型上不同性質(zhì)核小體的分布中心,構(gòu)建核小體定位性質(zhì)判別準(zhǔn)則,最終確定了轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上、下游定位良好和模糊核小體的位置。

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