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胡蘿卜ABF轉(zhuǎn)錄因子基因DcABF1的克隆與非生物脅迫應(yīng)答分析
關(guān)鍵詞：胡蘿卜 abf 轉(zhuǎn)錄因子 啟動(dòng)子分析 非生物脅迫
摘要：ABF轉(zhuǎn)錄因子是一種堿性亮氨酸拉鏈類(lèi)蛋白,與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境調(diào)控密切相關(guān)。該研究以胡蘿卜‘君川紅’為材料,克隆出編碼ABF轉(zhuǎn)錄因子的基因DcABF1,分析其編碼氨基酸的序列組成、進(jìn)化關(guān)系和蛋白質(zhì)理化性質(zhì)等;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)DcABF1基因在不同非生物脅迫下的應(yīng)答模式。結(jié)果顯示:DcABF1基因含有一個(gè)長(zhǎng)1 293 bp開(kāi)放閱讀框,編碼430個(gè)氨基酸,其蛋白質(zhì)分子量為104.96 kD,理論等電點(diǎn)為4.85。對(duì)DcABF1蛋白與其他植物的ABF家族成員進(jìn)行同源性比對(duì)與進(jìn)化樹(shù)分析表明,DcABF1與榴蓮中的ABF親緣關(guān)系最近。蛋白質(zhì)功能域預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),DcABF1蛋白中有28.84%的α螺旋和56.05%的無(wú)規(guī)則卷曲。DcABF1基因啟動(dòng)子區(qū)域含有多個(gè)順式調(diào)控元件。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,DcABF1基因?qū)Ω邷亍⒌蜏?、鹽脅迫均有響應(yīng),其表達(dá)水平在鹽處理下均高于對(duì)照,且于處理后4 h達(dá)到峰值,呈先上升后下降的趨勢(shì),但干旱處理下DcABF1基因的表達(dá)水平與對(duì)照相比均下降。
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