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利用DNA條形碼對10種蒼耳屬雜草的鑒定

袁俊杰; 馬新華; 龍陽; 魏霜; 張娜; 陳文; 楊卓瑜 湛江出入境檢驗檢疫局; 廣東湛江524022; 汕頭出入境檢驗檢疫局; 廣東汕頭515000

關(guān)鍵詞:its dna條形碼 蒼耳屬 雜草鑒定 

摘要:使用ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK等序列對截獲的10種蒼耳屬(Xanthium)雜草進行擴增測序,比較各序列的擴增和測序效率,采用最近距離法和相似性搜索算法評價不同序列的鑒定效率。采用最佳鑒定序列計算種間K2P距離并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果表明,ITS、psbA-trnH2個序列的擴增效率和鑒定效率最高;ITS序列的種間變異最大,其次是psbA-trnH序列,matK序列的種間變異最小;ITS序列的NeighborJoining(NJ)樹可明顯地將不同蒼耳屬雜草種分開;psbA-trnH序列可明顯地將國內(nèi)蒼耳種和檢疫性蒼耳種分開。說明利用DNA條形碼能夠準確地鑒別蒼耳屬雜草,ITS和psbA-trnH序列是鑒別蒼耳屬雜草較理想的條形碼組合。該研究結(jié)果為蒼耳屬雜草的分子鑒別提供了科學(xué)依據(jù)與新的思路。

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