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中國地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)的長鏈非編碼RNA差異表達(dá)譜建立及應(yīng)用
關(guān)鍵詞：中國地鼠 口腔鱗狀細(xì)胞癌 長鏈非編碼rna
摘要：目的 篩選中國地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌組織樣本中具有差異表達(dá)的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA),預(yù)測其靶基因,探究靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號通路。方法 采用二甲基苯并蒽涂抹法建立中國地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌模型,高通量測序技術(shù)構(gòu)建LncRNA差異表達(dá)譜,生物信息學(xué)技術(shù)篩選差異表達(dá)的LncRNA并進(jìn)行靶基因預(yù)測,GO與KEGG富集分析分別預(yù)測靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號通路。結(jié)果 與正常組織樣本相比,口腔鱗狀細(xì)胞癌組織樣本中篩選出54個顯著差異表達(dá)LncRNA(31個上調(diào),23個下調(diào))。功能性分析表明:與口腔癌相關(guān)的GO條目73條;KEGG富集的信號通路25條。結(jié)論 中國地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌樣本中差異表達(dá)的LncRNA可能通過靶向調(diào)控其靶基因參與調(diào)控多種生物學(xué)功能及口腔癌相關(guān)的信號通路,在口腔鱗狀細(xì)胞癌形成過程中可能發(fā)揮重要作用。
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