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夏大豆重組自交系群體遺傳圖譜構(gòu)建及開花期QTL分析
關鍵詞：大豆 開花期 遺傳圖譜 qtl
摘要：【背景】開花期是大豆重要的生育期性狀,不僅決定了大豆品種的適種范圍,而且對大豆的產(chǎn)量和品質(zhì)有重要影響。江淮地區(qū)是中國重要的大豆產(chǎn)區(qū),目前對該地區(qū)夏大豆開花期性狀遺傳基礎研究相對較少?！灸康摹坷?個夏大豆材料雜交衍生的重組自交系群體對開花期進行QTL定位,為分子標記輔助選擇育種和基因克隆提供依據(jù)。【方法】以科豐35(KF35)和南農(nóng)1138-2(NN1138-2)為親本,構(gòu)建了含91個家系(F2:8)的重組自交系群體(NJK3N-RIL),在6個環(huán)境下調(diào)查開花期性狀數(shù)據(jù)。利用限制位點相關DNA測序(restriction-site associated DNA sequencing,RAD-seq)技術對群體親本及家系材料進行SNP標記分型,并利用窗口滑動法進行bin標記劃分。利用bin標記構(gòu)建該群體的遺傳圖譜,結(jié)合多年多點的表型數(shù)據(jù),使用QTL Network 2.2軟件中的基于混合線性模型的復合區(qū)間作圖法(mixed-model based composite interval mapping,MCIM)和Windows QTL Cartographer V2.5_011軟件中的復合區(qū)間作圖法(composite interval mapping,CIM)對開花期性狀進行QTL分析?！窘Y(jié)果】在大豆全基因組范圍內(nèi)共獲得36778個高質(zhì)量SNP標記,被劃分為1733個bin標記。利用1733個bin標記構(gòu)建了一張覆蓋大豆20條染色體遺傳圖譜,圖譜長度為2362.4 cM,標記間平均遺傳距離為1.4 cM。利用MCIM法共檢測到9個控制開花期的加性QTL、2對上位性QTL和1個環(huán)境互作QTL,3種效應累積貢獻率分別為63.9%、4.6%和2.1%。利用CIM法共檢測到10個控制開花期的QTL,其中qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1、qFT-16-1能在3個及以上環(huán)境檢測到。綜合2種分析方法,共檢測到12個開花期QTL,其中qFT-8-1、qFT-11-1、qFT-15-1、qFT-16-1、qFT-16-2、qFT-20-1和qFT-20-2等能夠被2種方法檢測到。同時qFT-5-1、qFT-8-1、qFT-8-2、qFT-13-1、qFT-15-1和qFT-20-2等是本研究新檢測到的開花期QTL。【結(jié)論】夏大豆開花期遺傳構(gòu)成復雜,但加性QTL效應占絕對優(yōu)勢,上?
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