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江蘇省建蘭齒蘭環(huán)斑病毒的鑒定和遺傳多樣性分析
關(guān)鍵詞：建蘭 齒蘭環(huán)斑病毒 序列分析 系統(tǒng)發(fā)育分析
摘要：為防控江蘇省建蘭上的齒蘭環(huán)斑病毒(Odontoglossum ring spot virus,ORSV),采用酶聯(lián)免疫吸附反應(yīng)(enzyme-linked immuno sorbent assay,ELISA)和反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈鎖反應(yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)對采自江蘇省揚州市的16份具有典型感染ORSV病害癥狀的建蘭葉片樣品進行檢測鑒定,并結(jié)合GenBank中已報道的相關(guān)序列對其進行多樣性和系統(tǒng)發(fā)育樹分析。結(jié)果顯示,揚州市建蘭上ORSV檢出率高達100%;所獲得的ORSV分離物與GenBank中其它141個分離物的核苷酸序列一致率均在94%以上,所有ORSV分離物只能形成1個分組,且組內(nèi)多樣性水平低,不具備典型的寄主和地理特異性;6個ORSV種群間差異較小,種群多態(tài)性均較低,其中ORSV印度尼西亞種群的種群多態(tài)性最高,為0.025,ORSV德國種群和ORSV印度尼西亞種群之間的遺傳距離最高,為0.0244。表明不同地區(qū)、不同寄主種群ORSV分離物的遺傳差異很小,種群內(nèi)不同分離物有很高的相似性。
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