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巨龍竹肉桂醇脫氫酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析
關(guān)鍵詞：肉桂醇脫氫酶 巨龍竹 基因克隆 熒光定量
摘要：肉桂醇脫氫酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木質(zhì)素生物合成途徑的關(guān)鍵酶。研究根據(jù)巨龍竹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)的一對(duì)特異引物,運(yùn)用逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)技術(shù)從巨龍竹莖稈中克隆得到肉桂醇脫氫酶基因DsCAD,該基因包含1080 bp的完整c DNA開(kāi)放閱讀框,編碼359個(gè)氨基酸,理論相對(duì)分子質(zhì)量38689.6,等電點(diǎn)6.18。利用生物信息學(xué)方法對(duì)DsCAD進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守結(jié)構(gòu)域,具有植物CAD基因的典型特征;其與禾本科植物CAD基因的同源性較高,親緣關(guān)系較近,其中與孝順竹的同源性高達(dá)95%。熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果顯示DsCAD基因在巨龍竹竹筍中的表達(dá)量要高于莖稈,而在莖稈中的表達(dá)量有明顯高于葉。
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